A causa exata das enxaquecas não é conhecida, mas com base em estudos em andamento, acredita-se que seja devido a uma combinação de alterações que ocorrem no cérebro. Acredita-se que a enxaqueca seja causada por uma série de fatores desencadeantes específicos, vários produtos neuroquímicos, neurotransmissores defeituosos (CSDs) e alterações hormonais. A depressão propagada cortical (DCP) ocorre quando uma onda de hiperatividade varre o cérebro e impulsiona os neurônios ao longo do caminho. A maneira mais fácil de pensar no DCP é como uma sobrecarga dos circuitos cerebrais que faz com que os neurônios disparem esporadicamente. Ele pode se manifestar na forma de distúrbios visuais, como luzes piscando, formas e pontos brilhantes. A difícil tarefa para médicos e especialistas é que cada indivíduo é diferente e, se a genética e os neuroquímicos desempenham um papel importante, eles devem analisar um número considerável de variáveis. Certos fatores de risco foram identificados, incluindo idade, sexo e se há um histórico familiar de enxaquecas. Infelizmente, as mulheres têm muito mais probabilidade de sofrer de enxaqueca do que os homens, embora antes da puberdade esse número não seja significativo.